群体进化关系
利用全基因组重测序或简化基因组测序（dd-RAD）技术获得某物种自然群体各亚群的基因组信息，通过与参考基因组比对或聚类分析的方法得到大量变异信息，基于SN P信息讨论群体的遗传结构、基因交流情况、物种形成机制以及群体进化动态等生物学问题。
产品参数：
| 基于重测序 | 基于简化 |
测序平台及模式 | Illumina HiSeq, PE150 |
测序深度 | >10x/个体 | 混合建库；Tag数≥10万，平均10x/Tag |
项目周期 | 标准分析88天 | 标准分析80天 |
样本选择 | 同一物种自然群体的不同亚种（或品系），每个亚群样本数≥10； 群体数≥3；总体不少于30个样本 |
DNA样本量 | 总量≥0.5 μg，浓度≥10 ng/μl （单个样本） | 总量≥0.5 μg，浓度≥10 ng/μl （总样本） |
参考基因组 | 必须有参 | 无参或参考基因组较大
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技术线路：
信息分析内容：
序 号 | 分析项目 | 类 别 | 分 析 | 备 注 |
1 | 下机数据统计 | A | √ |
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2 | 数据质控 | A | √ |
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3 | 高质量数据获取 | A | √ |
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4 | 序列比对分析 | A | √ | 仅限有参 |
5 | 聚类分析 | A | √ | 仅限无参 |
6 | 测序深度及覆盖度概述 | A | √ |
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7 | 染色体覆盖深度分布 | A | √ |
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8 | 群体 SNP 检测、注释及统计 | A | √ |
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9 | 群体特异性SNP统计 | A | √ |
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10 | 系统发育树构建 | A | √ |
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11 | 群体主成分分析 | A | √ |
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12 | 群体遗传结构分析 | A | √ |
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13 | 群体遗传多样性分析 | A | √ |
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14 | 基因流分析 | A | √ |
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15 | 有效群体大小统计 | B |
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16 | 连锁不平衡分析 | B |
| 仅限有参 |
17 | 选择性清除区域检测 | B |
| 仅限有参 |
18 | 选择性清除区域基因的功能富集分析 | B |
| 仅限有参 |
19 | 亚群特异性SNP统计 | B |
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A：标准信息分析 B：高级信息分析 C：个性化分析
分析结果展示
