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全转录组测序




全转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA 的总和。包括mRNA、lncRNA、microRNA和circRNA等。可针对一份样本,同时分析mRNA、lncRNA、microRNA     和circRNA,揭示转录调控问题。可广泛应用于免疫机制研究、疾病领域研究、发育进化研究、致病机理研究和药物靶标研究等。


公司采用Ribo-Zero Gold rRNA Removal Kit(Illumina)去除总RNA中的rRNA,构建链特异性文库测序,获取lncRNA、mRNA、circRNA序列信息;采用TruSeq Small RNA Sample Prep Kit(Illumina)富集Small RNA测序,获取Small RNA序列信息。

方案设计

通过对一份生物学样本的不同实验方式,获得四种RNA的序列信息。针对四种RNA的数据进行分析,并对具有microRNA结合位点的RNA分子进行竞争性内源RNA(ceRNA)分析,可深度挖掘基因功能及调控机制,明确RNA 分子间调控模式。在进行取样时,每一组样品建议设置至少3个生物学重复。

技术线路

全转录组测序技术路线.jpg

高级分析内容展示


全转录组测序结果展示1.jpg

 
 


微生物菌种鉴定分析微生物组分析微生物检测分析 动植物基因组分析转录调控

   免费分析基因组dDDH值/ANI值

   真菌全基因组重测序

   细菌全基因重测序

   微生物新种鉴定分析

   微生物菌种多相鉴定分析

   酵母菌快速鉴定分析

   微生物序列分析

   菌群多样性组成谱全长测序

   菌群多样性组成谱测序

   宏基因组测序分析

   宏转录组测序分析

   标记基因全长测序

   扩增子/功能基因测序

   第三代高通量测序平台

   饲料检测与安全评价

   真菌基因组de novo测序

   细菌全基因组完成图测序

   真菌近完成图测序

   环境中活菌群分析

   产品微生物解析

   产品污染菌分析

   动植物基因组全长三代测序

   动植物基因组de novo测序

   SSR分子标记开发

   全基因组关联分析

   群体进化关系

   遗传图谱构建

   BSA性状定位

   免费分析基因组dDDH值/ANI值

   全长转录组测序

   全转录组测序

   转录组测序

   Small RNA测序

   SSR/STR/微卫星DNA技术

   扩增片段长度多态性(AFLP)


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